流程创建
我们的平台是基于工作流进行任务计算的，所以任何任务的分析必须先创建流程，如果你是从社区订阅的流程，那么可以跳过这一步。如果你订阅的是工具，你需要基于工具，构建分析流程。由于创建任务时，第一步是选取流程，所以如果您只想跑单一的一个工具，也需要将这个工具制作成流程。同样，您可以将多个工具串联在一起，完成复杂流程的制作。我们在项目中点击项目导航栏中的Flow按钮，再点击右侧的Create flow按钮，创建一个新流程。
建流程页面有3个板块需要编辑，流程名称（Flow name） / 流程图（Flow path construction） / 流程描述（Description）。
| 类型 | 描述 |
|---|---|
| Flow name | 编辑流程的名称，不能与其他流程重名 |
| Flow path construction | 在左侧选择特定版本工具，点击并拖至右侧，连接工具上的端口，完成流程的构建 |
| Description | 流程描述，markdown编辑器，可按提供的模板编辑 |
以三个工具为例，我们的 flow name 设置为fastq2bam。我们的 Flow path construction 构建方式如下图。
这里我们可以看到当工具被拖入右侧画布时，工具两侧会出现端口（port）。这里的端口是输入文件和输出文件一一对应的，是工具暴露给用户用于连线的，表示文件的流向。
对于构建流程来说，用户可以通过端口快速了解工具的输入，输出文件是什么，从而将多个工具串联在一起。点击工具左侧端口拖拽至空白处，表示端口需要文件输入，点击工具右侧端口拖拽至空白处，表示端口文件会被最终输出。
工具A与工具B之间的连线代表，A工具的输出文件，将被作为B工具的输入文件，此时需要注意的是A工具输出文件的文件格式要满足B工具输入文件格式的要求。
工具A与工具B之间的连线仅代表文件从A工具流向B工具，并不会作为流程的最终输出，如果您想让该文件输出，您可以在工具A的输出文件端口再拖拽一条线，不连接到任何工具，这时它将被系统识别，并作为最终输出文件输出。
我们也可以创建一个相对复杂的流程
构建完流程图之后，如果您还需要对特定的工具参数进行修改，您还可以点击画布中特定工具的图标，点击设置图标，在弹框中进一步工具进行配置。这里主要是配置工具的参数项以及每个工具所需要的计算资源，你可以根据作者的说明进行调整，不调整即按默认参数进行分析。
以下是工具配置项目中的字段说明：
| 类型 | 描述 |
|---|---|
| 顶部说明 | 工具的使用说明 |
| CMD | 工具运行时的命令行（如何制作一个工具中有详细描述，如果只运行工具可不做了解） |
| param list | 参数列表，包含输入输出信息以及工具参数 |
| prefix | 在命令行中的是否有前缀（如何制作一个工具中有详细描述，如果只运行工具可不做了解） |
| type | 数据类型，数字（Number），字符串（String），输入文件（Input），输出文件（Output） |
| key | 参数的描述，唯一性，不可重复，一般在说明中通过key告诉用户参数的功能以及如何设置 |
| value | 参数设置，用户可以进行修改（Number和String）类型 |
| is select | 是否在运行工具时需要该参数，打勾表示需要，必须参数一定会打勾，对于标识性参数，可以通过这个选项判断是否需要该参数 |
| input / output | 输入文件 / 输出文件 |
| dir | 输入/输出文件在docker中放置的子文件夹位置（如何制作一个工具中有详细描述，如果只运行工具可不做了解） |
| port | 端口名字，在流程图中显示的端口的名字，告知用户这个端口需要输入/输出的文件内容 |
| type | 文件类型，item表示单个文件输入/输出，array表示这个端口可以同时输入/输出多个文件 |
| pattern | 文件后缀，如.csv表示只支持csv文件格式的输入/输出。表示支持任意文件格式输入/输出 |
| Computer selection | 该docker工具所需要的计算资源 |
| CPU | CPU个数 |
| RAM | 最大内存依赖 |
| DISK | 最大磁盘存储 |